Bioinformatiker/Systemutvecklare, Centrum för Molekylär Diagnostik
Region Skåne
Lund , SE
16 dagar sedan

Gör skillnad. Varje dag.

Centrum för Molekylär Diagnostik (CMD) bildades i januari 2016 i syfte att stärka molekylär diagnostik baserad på i första hand den nya generationens sekvenseringsteknik (NGS).

CMD är en del av verksamhetsområde Klinisk genetik och patologi men utgör ett resurs- och kompetenscentrum för samtliga laboratoriemedicinska verksamheter som bedriver NGS-

baserad diagnostik. Verksamheten arbetar i nära samverkan med både Skånes Universitetssjukhus (SUS) och Medicinska Fakulteten vid Lunds Universitet i syfte att stärka klinisk implementering och forsknings- och utvecklingsarbete.

Vid CMD arbetar cirka 15 medarbetare med expertis inom NGS, bioinformatik och olika sjukdomsområden (till exempel ärftliga och förvärvade sjukdomar).

Verksamheten är mycket utvecklingsintensiv men består även av rutindiagnostik i allt större utsträckning (till exempel används NIPT, genpaneler och exomsekvensering för olika frågeställningar).

Under året planeras ett omfattande arbete för att automatisera delar av laboratoriet, flytta till nya specialanpassade lokaler och för att uppnå en verksamhetsövergripande ackreditering.

Arbetet vid CMD sker i nära samarbete med Centrum för Translationell Genomik (CTG), ett motsvarande resurs- och kompetenscentrum för translationell forskning vid Lunds Universitet.

CMD och CTG utgör tillsammans även Clinical Genomics Lund, vilken är en nationell SciLifeLab-facilitet under Diagnostics Development-plattformen.

Arbetsuppgifter

Vi söker nu ytterligare en driven och engagerad medarbetare till CMD!

I ditt arbete kommer du att vara delaktig i uppbyggnaden och driften av en modern klinisk diagnostik laboratorieverksamhet inom hälso-

och sjukvården baserad på NGS-teknologin.

Du kommer att vara en del av bioinformatikteamet som idag består av fem bioinformatiker, utvecklare och systemadministratörer.

Bioinformatikteamet ansvarar för utveckling och drift av mjukvaror och analysflöden för klinisk drift, inkluderande både kommersiell mjukvara, egenutvecklade verktyg samt öppna mjukvaror som till exempel Scout (https : / / github.

com / Clinical-Genomics / scout).

CMD kommer under 2018 att ta i drift ett beräkningskluster vid Lunds Universitets superdatorcentrum (LUNARC) för att tillgodose sina beräkningsbehov.

Bioinformatikteamet spelar även en viktig och ledande roll vid utvärdering och testning av nya tekniker och metoder.

Du kommer att arbeta med utveckling och anpassning av bioinformatiska verktyg för att underlätta, standardisera och kvalitetssäkra tolkning samt rapportering av resultat från NGS-

analyser inom ett flertal olika diagnostikområden. Du kommer att ha en nyckelroll som lead developer för egenutvecklad mjukvara men förväntas också vara en viktig del i implementering och utveckling av öppna mjukvaror som används nationellt och internationellt.

Du kommer vidare att samverka nära med de labmedicinska verksamheterna inom Medicinsk service och CTG. Vidare ingår CMD i ett stort nationellt nätverk (Genomic Medicine Sweden) som gemensamt driver utvecklingen av denna nya diagnostik framåt.

Utveckling av bland annat bioinformatik kommer delvis ske inom detta större nätverk i samarbete med ett stort antal bioinformatiker och utvecklare över hela landet.

Kvalifikationer

För tjänsten krävs adekvat högskole- eller universitetsutbildning, minst kandidatexamen, inom till exempel bioinformatik eller datavetenskap, alternativt civilingenjörsutbildning.

Då tyngdpunkten för tjänsten ligger på mjukvaruutveckling ser vi gärna att du har gedigen erfarenhet inom området. Nyckeltekniker att behärska för tjänsten inkluderar skriptspråk (Python / Perl), databasteknik (SQL / mongodb), webbutveckling samt versionshanteringssystem (git).

Vidare är erfarenhet inom HPC en fördel. Viss grundkännedom inom basala biologiska och medicinska frågeställningar är meriterande.

Även systemadministratörserfarenhet av Linuxbaserade system är meriterande. Mycket goda kunskaper i svenska och / eller engelska är en förutsättning för tjänsten, i såväl tal som skrift.

Som person vill vi att du har ett noggrant, kvalitetsmedvetet och självständigt arbetssätt samt god analytisk och kommunikativ förmåga, såväl muntligt som skriftligt.

God samarbetsförmåga och flexibilitet krävs och stor vikt kommer att läggas vid personlig lämplighet.

Vi tillämpar löpande urval i denna rekrytering, varmt välkommen med din ansökan redan idag!

Övrigt

Region Skåne ansvarar för hälso- och sjukvård, kollektivtrafik och en hållbar utveckling i hela Skåne. Vårt högsta beslutande organ är regionfullmäktige, som väljs direkt av invånarna i Skåne.

Region Skåne är en värderingsstyrd organisation som arbetar med värderingarna välkomnande, drivande, omtanke och respekt i allt vi gör.

Förvaltningen Medicinsk service stödjer samtliga Region Skånes egna verksamheter och privata vårdgivare med laboratoriemedicinska-

medicintekniska samt bild- och laboratorietekniska tjänster. Vi är drygt 1500 medarbetare och finns representerade på alla sjukhusområden i Skåne.

Just nu är Medicinsk service inne i en uppbyggnadsfas av en ny division : MT / Prehospital sjukvård.

På http : / / www.skane.se / rekryteringsstatus kan du se i vilket skede Region Skånes rekryteringar befinner sig och hur många som har sökt tjänsterna.

Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare :

Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.

Ansök
Ansök
Min e-post
Genom att klicka på "Fortsätt ", samtycker du till att neuvoo samlar in och bearbetar dina personuppgifter, som du har tillhandahållit i detta formulär, för att skapa ett neuvoo-konto och prenumerera dig på våra e-postaviseringar, i enlighet med vår Sekretesspolicy . Du kan när som helst återkalla ditt medgivande genom att följa dessa steg .
Fortsätt
Ansökningsblankett